口腔干细胞由国际口腔界知名科学家施松涛教授发现并命名，施松涛教授在2000年首次辨认和分离了牙髓干细胞(DPSCs) (ProcNatlAcadSci USA2000)，从人脱落的乳齿(SHED)中分离出了干细胞、牙周韧带干细胞(PDLSCs)，从顶端孔头(SCAP)分离出干细胞(ProcNatlAcadSci USA 2003; Lancet 2004; PLoS ONE 2006)及牙龈干细胞(GMSCs)。目前已经使用这些干细胞再生各种口面组织，包括口面骨、牙周组织、生物根及牙齿再生。另外，他还设法确定骨髓间叶干细胞(BMMSCs)对人体疾病的病理性过程的作用，例如骨质疏松症和系统性红斑狼疮，并且探索骨髓间叶干细胞(BMMSCs)的潜力及使用进行它疾病治疗。
目前科学家发现的口腔干细胞主要包括6种：牙髓干细胞(DPSCs)、脱落乳牙牙髓干细胞(SHED)、牙周膜干细胞(PDLSCs)、根尖牙乳头干细胞(SCAP)、牙囊前体干细胞(DFPC)及牙龈干细胞(GMSCs)。自上世纪60年代发现造血干细胞以来，科学家发现骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells，BMMSCs)具有强大的增殖能力和多向分化潜能，在适宜的体内或体外环境下可以分化为成骨细胞、脂肪细胞、肌细胞、肝细胞、软骨细胞和基质细胞等多种细胞，为细胞、组织、器官修复和移植提供了新的细胞来源。口腔干细胞取材存储方便，免疫原性小，免疫调节能力强，临床应用安全性好，在颌面部组织再生及全身系统疾病的治疗应用方面有着巨大前景。
乳牙是人体唯一自然脱落的器官，乳牙(智齿、恒牙)中提取的干细胞是自体骨髓干细胞活性的三倍。口腔干细胞目前的有效采集源为儿童的乳牙和二十岁前青少年的恒牙和智齿。